Фамилия Жуганов — один из тех случаев, где за простым звучанием скрывается как минимум две равноправные версии происхождения, и обе уходят корнями в народную речь и быт. Спор здесь не в том, какая гипотеза вернее, а в том, какую картину жизни предков выберет сам носитель фамилии.

Первая версия отталкивается от глагола «жугакать». В рязанских говорах это слово означало «стучать, возиться, шуметь». Если принять эту основу, то прозвище Жуган получал человек, чья работа была неразрывно связана с грохотом и шумом: кузнец, плотник, лесоруб. Суффикс -ан в русских прозвищах часто указывал на деятеля, склонного к действию, выраженному глаголом. В таком случае Жуган — это «тот, кто жугакает», то есть постоянно стучит или гремит. Фамилия, образованная от подобного прозвища, прямо указывает на ремесло или характерную особенность предка.

Вторая версия предлагает иной, более поэтичный образ. Она связывает основу с диалектным словом «жуга» — так в некоторых областях называли первый тонкий лед на реке, который появляется поздней осенью. Если Жуган — это мирское имя, данное ребенку, родившемуся в эту пору, то фамилия несет в себе не профессиональную, а календарную и природную привязку. Имена по времени года или природным явлениям были распространены в крестьянской среде до повсеместного внедрения церковных календарей.

С точки зрения словообразования фамилия абсолютно прозрачна: основа Жуган- плюс типичный русский суффикс принадлежности -ов. Она означает «сын Жугана» или «из рода Жугана». В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образовывались от основ на -а/-я, форма Жуганов — это стандартная патронимическая модель от мужского прозвища или имени, оканчивающегося на твердый согласный. Фамилия встречается в основном в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает ее связь с южнорусскими говорами, где бытовал и глагол «жугакать», и слово «жуга».