Фамилия Зинковская — типичный пример того, как редкое каноническое имя обрастало бытовыми формами и в итоге дало начало родовому имени. В основе фамилии лежит производная форма мужского имени Зиновий — Зинка или Зинко. Имя Зиновий пришло из греческого языка и означает «рождённый богом» или «богоугодно живущий». В русской традиции такие усечённые формы (Зинка, Зинко) были распространены в простонародной среде, поэтому основатель рода Зинковских, скорее всего, был человеком из простого сословия.

Суффикс -ск- в фамилии указывает на её происхождение от географического названия или прозвища, оформленного по польско-украинской модели. В данном случае фамилия могла возникнуть как ответ на вопрос «чей?»: Зинковский — сын или потомок Зинка. Женская форма Зинковская закрепилась за представительницей рода, чьи предки носили прозвище Зинко.

Существует и менее правдоподобная версия, связывающая основу фамилии с женским именем Зинаида (от греческого «рождённая Зевсом»). Однако такая гипотеза слабее: женские имена реже становились основой для фамилий на -ский, особенно в старых крестьянских родах. Таким образом, Зинковская — это потомок человека по имени Зиновий, чьё бытовое прозвище Зинко со временем превратилось в фамилию.