Фамилия Золотоногина — женская форма фамилии Золотоног, и это сразу даёт ключ к её разбору. Мужской вариант Золотоног встречается крайне редко, и образован он не от имени, а от прозвища: «золото» + «нога». В русской ономастике такие составные прозвища — не редкость, но обычно они описывают внешность, походку или особую примету: например, Кривоног, Белоног, Сухоног. Золотоног — случай особый: «золотая нога» могла означать либо человека с необычайно лёгкой, быстрой походкой (золото как символ ценности и редкости), либо того, кто носил дорогую обувь — сапоги с золотым шитьём или позолоченными подковами. В крестьянской среде это было бы заметно сразу и давало повод для прозвища.

Суффикс -ин в основе Золотоног-ин указывает на принадлежность: «чей?» — Золотоногин, то есть сын или потомок Золотонога. Это типичная модель русских фамилий XVI–XVII веков, когда прозвище отца переходило к детям с прибавлением -ин (если основа оканчивалась на -а/-я) или -ов/-ев (если на согласный). Здесь основа на твёрдый согласный «г», но суффикс -ин — не ошибка: в северных и центральных говорах фамилии от прозвищ на -ог, -ок, -ек нередко получали именно -ин (ср. Бородин, Сапогин). Это говорит о возможном севернорусском или владимирском происхождении.

Версия, что фамилия могла возникнуть из прозвища по профессии — мастера, делавшего золотые ножки для мебели или окладов, — маловероятна. Такое прозвище было бы слишком узким и не закрепилось бы как фамильное. Куда правдоподобнее, что Золотоног — человек с «золотыми ногами», то есть либо удачливый ходок, либо щеголь в дорогой обуви. В любом случае, фамилия редкая, и её носительницы могут считать себя обладательницами нестандартного, почти сказочного прозвищного корня.