Фамилия Зудин образована от прозвища или нецерковного имени Зуда. Основа здесь — нарицательное «зуда», которое в старых говорах означало «егоза, непоседа», а также «охотник подшучивать, подтрунивать». Скорее всего, так называли человека живого, беспокойного — ребёнка-шалуна или взрослого, который любил задирать и дразнить окружающих. Суффикс -ин указывает на типичную восточнославянскую модель «чей?»: Зудин — сын Зуды.

Существует и вторая версия, но она менее убедительна. Согласно ей, имя Зуда было «охранительным» — его давали ребёнку, чтобы отвести от него злые силы. Смысл такого имени строился на противопоставлении: назовут Зудой (то есть докучливым, надоедливым), а дитя вырастет здоровым и спокойным. Однако для фамилии основным всё же остаётся прямое значение прозвища — по характеру поведения.

Фамилия нередко встречается в документах XX века. В Книге памяти Кировской области упомянут Александр Сергеевич Зудин (1923 года рождения, из Орехово-Зуева). В пензенских архивах сохранилась запись об Алексее Колистратовиче Зудине (1882 года рождения, село Коржевка). Нижегородские источники сообщают об Алексее Якимовиче Зудине (1887 года, село Нуча Ардатовского района). Эти записи показывают, что носители фамилии были рассеяны по разным губерниям — от центра до Поволжья.

Из известных однофамильцев — актриса Марина Вячеславовна Зудина, заслуженная артистка России.