Фамилия Зульфугаров — тюркская по происхождению, с арабским корнем. В основе лежит мужское имя Зульфугар, которое восходит к арабскому Zulfiqār — так назывался легендарный меч халифа Али, двоюродного брата и зятя пророка Мухаммеда. Это имя особенно распространено среди мусульман-шиитов, почитающих Али как первого имама. Таким образом, фамилия Зульфугаров буквально означает «сын Зульфугара» или «потомок человека по имени Зульфугар».

Суффикс -ов в русской передаче указывает на адаптацию тюркской фамилии к русской грамматической модели. В исходных тюркских языках (азербайджанском, турецком, туркменском) фамилия звучала бы как Zülfüqarov или Zülfügarov, без окончания. В русском языке окончание -ов стало стандартным способом русификации фамилий народов Кавказа и Средней Азии, особенно в советский период, когда паспортная система унифицировала написание.

География фамилии сосредоточена в Азербайджане, Дагестане и среди азербайджанской диаспоры. Встречаются также варианты написания: Зульфугаров, Зюльфюгаров, Зульфикаров. Последний вариант, Зульфикаров, ближе к арабскому произношению и чаще встречается у таджиков и узбеков. Разница в написании отражает не столько ошибку, сколько местные фонетические особенности: в азербайджанском языке звук «ю» часто передается как «у».

Сословно фамилия не привязана к дворянству или знати. Её носители — потомки крестьян, ремесленников или торговцев, получивших фамилию просто по имени отца. В дореволюционных записях фамилия почти не фиксируется, что типично для мусульманских народов Российской империи, у которых фамилии массово появились только в 1920–1930-е годы.

Интересная деталь: имя Зульфугар, несмотря на религиозный подтекст, в народной среде иногда переосмыслялось как символ храбрости и воинской доблести. Поэтому среди носителей фамилии встречаются потомки военных — от рядовых солдат до офицеров, особенно в период Кавказской войны XIX века. Однако это лишь вероятная связь, а не строгое правило.